对于FVCOM2.7.1 其使用的PETSC版本应该是2.3.3（副版本好变，目前最新的是这个），使用这个版本你可以不用修改FVCOM的源代码

其次，PETSC需要开启Hypre的支持，configure的使用需要--with-hypre=1 --with-hypre-dir=/hypre/install/dir

最新的库可以从官方网站下载：

PETSC:http://www.mcs.anl.gov/petsc/download/index.html

HYPRE:http://acts.nersc.gov/hypre/

你可以可以使用PETSC的3.0版本，但需要适当的修改一下makefile和mod_petsc.F和（省略）的源代码修正include的目标文件夹。

程序库的编译，如果您的已经安装了mpi，和intel compiler （会带mkl库），推荐不要给定其他configure参数。